5号染色体臂内倒位是可以做三代试管婴儿生育健康宝宝的。一般如果父母是存在5号染色体臂内倒位，其基因片段都是完整的，只是染色体结构存在异常，这会导致怀孕出现反复流产、胎停，极少数可能会出现胎儿发育畸形的情况，但一般都是能生育健康孩子的。如果担心可以做三代试管生育，其能排除掉5号染色体臂内倒位这类染色体结构异常的胚胎，移植健康胚胎生育后代。

染色体臂间倒位是临床上较为常见的染色体异常情况，其对生育存在一定的影响，会出现胎停、反复流产、早产等情况，少部分会出现胎儿畸形。这些问题都可以通过三代试管婴儿技术解决，目前三代试管pgs筛查可以对胚胎进行染色体数目和结构异常的检测，主要查看染色体结构、数目是否异常，而5号染色体臂内倒位就属于是染色体结构异常，通过三对试管技术就可以排除生育健康的孩子。