三代试管虽然大部分移植的都是筛查过后的囊胚，但是胚胎不着床的原因不一定是胚胎质量不好，也有可能是女性心理原因或者子宫内膜的原因，像在做第三代试管婴儿的时候，如果母亲过度紧张、焦虑，就会出现情绪波动，导致内分泌异常，可能就会导致试管婴儿操作失败出现不着床的现象。另外，受精卵着床需要子宫内膜厚度达到一定程度，子宫内膜薄会不利于受精卵的着床。所以，就算三代试管筛查过的囊胚质量好，也会因为其他原因导致胚胎不着床，所以三代试管不是100%成功。

第三代试管婴儿胚胎筛选已经达到成熟阶段，其检测结果的准确性也得到了很大的提高，达到98%。不过，虽然第三代试管婴儿胚胎筛查的准确性非常高，但不能保证100%准确。

这主要是由于以下原因：　　

1、胚胎发育过程中可能会发生突变或变异，导致检测结果与实际情况不一致;　　

2、测试过程中的操作技术和实验环境也会影响测试的准确性。

因此，在进行第三代试管婴儿胚胎筛查时，医生需要综合考虑检测结果的准确性以及可能出现的误差，并与夫妻进行充分的沟通和讨论。

相较于前两代而言，三代试管婴儿在移植前就会进行遗传学诊断及筛查，目的就是在于挑选拥有优质基因序列的胚胎。从这方面来说，三代试管婴儿检测不仅对胚胎没有影响，反而是有利的。另外，在三代试管婴儿移植后，也是需要进行常规产前检查的，包括血常规、超声等，主要是检测胎儿发育的情况是否顺利，与正常的妊娠过程是一样的。因此，也不必担心这些检查在移植后会对胎儿造成不良影响。　

总之，三代试管婴儿筛查后的胚胎也会有不着床的情况，因为筛查后的胚胎并不是100%没有问题，就算没有问题，也会因为女性的情绪、子宫内膜等个人情况导致胚胎着床失败，所以三代试管不是100%成功。